Відсутність менструації або аменорея може траплятися як на етапі статевого дозрівання у дівчаток, так і в більш пізні періоди життя жінки. Первинна аменорея характеризується повною відсутністю менструального циклу від народження до 16 років.

При порушеннях функцій гіпоталамуса, - області мозку, яка відповідає за менструальний цикл і тілесні функції. Підвищена фізична активність, навантаження, розлади харчової характеру. наприклад, - анорексія, а також психологічне і фізичне напруження - можуть привести до зміни діяльності гіпоталамуса.
Читайте також: чому в перший день місячних болить живіт
У виняткових випадках утворення пухлини в гіпоталамусі стає підставою для тимчасової зупинки його нормального функціонування.
Зустрічаються і такі форми відхилень, при яких в процесі ембріонального розвитку з'являються аномалії, при яких дівчатка народжуються з частковою відсутністю органів жіночої репродуктивної системи, наприклад, шийки матки, матки або піхви. У зазначених випадках відсутність менструації пояснюється саме недостатньою розвиненістю репродуктивної системи.
Структурні вагінальні патології будови піхви можуть перешкоджати виникненню менструальної кровотечі. Піхву може бути закритий мембраною, яка перешкоджає належному притоку крові до шийки матки і матці.
Привести до вторинної амінорее можуть стрес, інфекційні захворювання, гормональний дисбаланс, низька вага тіла, дисфункції щитовидної залози, пухлини гіпофіза, внутрішньоматкові рубці і спайки.